Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smn1P97801 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smn1P97801 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smn1P97801 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smn1P97801 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smn1P97801 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smn1P97801 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smn1P97801 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smn1P97801 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smn1P97801 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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