Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3aP97351 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms