Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkp1P97350 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp1P97350 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms