Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcgP82348 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SgcgP82348 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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