Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SgcdP82347 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SgcdP82347 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SgcdP82347 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcdP82347 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SgcdP82347 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcdP82347 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcdP82347 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcdP82347 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcdP82347 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcdP82347 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SgcdP82347 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcdP82347 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcdP82347 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgcdP82347 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcdP82347 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgcdP82347 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SgcdP82347 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SgcdP82347 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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