Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx3P81067 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx3P81067 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx3P81067 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx3P81067 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms