Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-Q6P79568 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms