Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1bP70700 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms