Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rit1P70426 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rit1P70426 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rit1P70426 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rit1P70426 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rit1P70426 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms