Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf11P70378 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms