Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad1P70340 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms