Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra8P70278 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra8P70278 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms