Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrig1P70193 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrig1P70193 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms