Protein–RNA interactions for Protein: P63330

Ppp2ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2caP63330 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppp2caP63330 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms