Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps3P62908 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms