Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl23aP62751 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms