Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms