Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2d1P61080 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d1P61080 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms