Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sem1P60897 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sem1P60897 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms