Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rin3P59729 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rin3P59729 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms