Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup43P59235 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup43P59235 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup43P59235 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup43P59235 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms