Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samsn1P57725 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samsn1P57725 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms