Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp25P57080 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms