Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd5P56812 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms