Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms