Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtskP55097 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtskP55097 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtskP55097 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtskP55097 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtskP55097 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtskP55097 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtskP55097 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms