Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn1P54254 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn1P54254 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms