Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RabggtbP53612 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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