Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp10P52479 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms