Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClgnP52194 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms