Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc4P51655 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc4P51655 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms