Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntfP51642 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntfP51642 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CntfP51642 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CntfP51642 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms