Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Opn1swP51491 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Opn1swP51491 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Opn1swP51491 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Opn1swP51491 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Opn1swP51491 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms