Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RorcP51450 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RorcP51450 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RorcP51450 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RorcP51450 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RorcP51450 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RorcP51450 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RorcP51450 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RorcP51450 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RorcP51450 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RorcP51450 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RorcP51450 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RorcP51450 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RorcP51450 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RorcP51450 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RorcP51450 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RorcP51450 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms