Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FmodP50608 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FmodP50608 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FmodP50608 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FmodP50608 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms