Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpbP50405 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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