Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cav1P49817 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms