Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Tmod1P49813 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Tmod1P49813 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Tmod1P49813 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Tmod1P49813 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Tmod1P49813 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tmod1P49813 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tmod1P49813 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tmod1P49813 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tmod1P49813 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod1P49813 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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