Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psen1P49769 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psen1P49769 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psen1P49769 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms