Protein–RNA interactions for Protein: P49722

Psma2, Proteasome subunit alpha type-2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma2P49722 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psma2P49722 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psma2P49722 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms