Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd1P48410 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd1P48410 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms