Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Edn3P48299 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Edn3P48299 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Edn3P48299 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Edn3P48299 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Edn3P48299 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms