Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbx2P48031 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms