Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CratP47934 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CratP47934 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CratP47934 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CratP47934 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CratP47934 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms