Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg3P47867 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms