Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klf1P46099 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf1P46099 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms