Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc19a1P41438 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc19a1P41438 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms