Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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