Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps26aP40336 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms