Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms